在中国刑事诉讼中，认罪认罚制度是一项重要的司法改革措施，旨在通过犯罪嫌疑人、被告人自愿承认其犯罪事实和接受相应处罚，以简化诉讼程序，提高效率。然而，尽管认罪认罚在一定程度上减少了审判环节，但并不意味着被告人的权益被剥夺，他们仍然享有上诉的权利。

根据《刑事诉讼法》的相关规定，犯罪嫌疑人、被告人对于侦查机关的讯问有沉默权，也有权为自己辩护，这包括选择是否认罪认罚。如果他们选择认罪认罚，通常会与检察官达成量刑协议，即在一定的范围内接受较轻的处罚。但这并不意味着判决结果一旦确定，就不能上诉。

《刑事诉讼法》第一百八十五条规定：“当事人对第一审判决不服的，有权在法定期限内提起上诉。”这里的“当事人”包括被告人，即使他们在认罪认罚协议中选择了从轻处罚，但在认为判决存在错误或者违反法定程序时，依然有权行使上诉权利。

上诉的理由可能包括对事实认定的异议、证据的质证问题、量刑过重或过轻等。如果法院在审理过程中确实存在程序瑕疵或者事实认定有误，被告人完全可以通过上诉程序寻求纠正。同时，虽然认罪认罚协议在一定程度上限制了上诉的空间，但法律并未禁止对量刑部分提出异议，只要理由正当，法院仍可能予以考虑。

值得注意的是，认罪认罚并不意味着被告人放弃辩护权。辩护律师可以在上诉程序中继续为被告人辩护，提供新的证据或者法律依据，帮助法庭做出更为公正的裁决。因此，认罪认罚后的上诉并非没有意义，反而可能是维护被告人合法权益的重要途径。

总的来说，认罪认罚制度与上诉权并不冲突，二者共同构成了我国刑事诉讼体系的一部分。被告人有权在尊重法律程序的前提下，根据自身情况选择是否认罪认罚，而无论选择何种方式，他们都拥有上诉的权利，以确保司法公正的实现。