在中国的刑事诉讼法中，认罪认罚制度是一项重要的司法改革措施，旨在提高司法效率，减轻司法压力，同时让犯罪嫌疑人、被告人更好地接受法律制裁。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，对于三年以上有期徒刑的案件，认罪认罚在一定程度上可能影响法院的判决结果。

根据刑法规定，对于被判处三年以上有期徒刑的犯罪，被告人在审判阶段自愿认罪并愿意接受处罚的，法院可以根据其认罪悔罪的表现和案件的具体情况，依法从轻或者减轻处罚。这种情况下，如果被告人的认罪态度良好，对社会危害性较小，且有悔过表现，法院可能会考虑适用缓刑。

然而，缓刑的适用并非一蹴而就，而是需要满足一系列条件。被告人的犯罪行为必须是过失犯罪或者情节较轻的故意犯罪；其次，被告人的社会危险性较低，没有再犯可能性；被告人的悔罪表现真实，且有社区矫正的必要和可能。根据刑法修正案的规定，对于累犯、严重暴力犯罪等特定类型的犯罪，即使认罪认罚，也不得适用缓刑。

认罪认罚制度的实施还依赖于完善的量刑程序和配套的法律援助体系，确保被告人充分了解自己的权利和义务，避免因信息不对称导致的误判。因此，即使被告人的刑期超过三年，能否最终获得缓刑，还需要综合考量其认罪悔罪程度、犯罪事实、个人情况以及社会影响等因素。

总的来说，认罪认罚制度为三年以上有期徒刑案件提供了可能性，但并不意味着必然能获得缓刑。法院在判断时会严格遵循法律规定，以确保司法公正和社会稳定。因此，对于任何涉嫌犯罪的人，无论是三年以上的刑期还是其他情况，都应该积极面对法律，真诚悔过，争取得到公正的处理。